In den Königreichen Birabuto, Muda, Easton und Chai taucht eines Tages der Außerirdische Tatanga auf und reißt die Herrschaft an sich. Dazu hypnotisiert er die Bewohner und entführt die Prinzessin des Landes, Daisy. Als Mario dies erfährt bricht er auf um Tatanga zu besiegen und Daisy zu retten.
Dr. Robotnik konnte einen Chaos Emerald von South Island stehlen und erzeugt so Erdbeben und Aufruhr auf der Insel. Durch Flicky the Bluebird erfahren Sonic und Tails dass die Chaos Emeralds aus der Nordhöhle der Insel stammen. Danach sehen sie Dr. Robotnik mit dem Chaos Emerald davonfliegen. Mit diesem will er Atomwaffen und Laserkanonen bauen. Allerdings führt dies zu einem Ungleichgewicht in den Chaos Emeralds und lässt die verbleibenden in ein Paralleluniversum verschwinden. Um zu verhindern, dass South Island irgendwann im Ozean zusammenbricht, wollen Sonic und Tails die Chaos Emeralds zurückholen und das Universum wieder ins Gleichgewicht bringen.
Es ist Frieden auf South Island eingekehrt und Sonic entscheidet sich auf eine kleine Reise zu gehen. Als er zurückkehrt ist die Insel fast vollkommen verlassen. Durch einen Brief von Tails findet er heraus dass Dr. Robotnik ihn und die anderen Tiere der Insel in Crystal Egg gefangenhält und sie nur freilässt, wenn er dafür die sechs Chaos Emeralds erhält. Sonic beginnt darauf direkt seine Reise in Richtung Crystal Egg, um dort Dr. Robotnik zu besiegen und alle zu rettten, ohne die Chaos Emeralds zu übergeben.
Die Welt wird von unzähligen tyrannischen Menschen beherrscht und wir machen uns auf, sie zu stürzen und die Welt unter unserer friedlichen Herrschaft zu vereinigen.
Dr. Ivo Robotnik ist auf der Suche nach den sechs Chaos Emeralds, welche über mystische Kräfte verfügen sollen. Dabei hat er auch die Tiere von South Island in Roboter verwandelt und in Metallbehälter gesperrt. Sonic will nun die Tiere befreien und den bösen Wissenschaftler aufhalten.
Während der Weihnachtsfeier des Chemieunternehmens Microtech bricht ein großes Feuer aus. Die Feuerwehrmänner Pete und Daniel werden, zusammen mit einem zweiten Feuerwehrpaar, das sich in einem anderen Teil des Gebäudes befindet, geschickt und sollen das Feuer löschen, sowie die Menschen im Gebäude retten.
Chell ist eine Testperson für die Forschungseinrichtung Aperture Science Enrichment Center der Aperture Laboratorie, welches ein Konkurrenzunternehmen der Black Mesa Research Facility ist. Sie befindet sich in einem Glaskubus, welcher sich in einem sterilen, mit Überwachungskameras ausgestatteten, Labor befindet. Dort wird sie von der Computerstimme des Genetic Lifeform and Disk Operating System, kurz GLaDOS, begrüßt und aufgefordert an diversen Tests teilzunehmen.
Mit dem Tod Stalins kämpfen nun alle, die ihn umgaben, um die Macht und Kontrolle über das Land. Lena hat herausgefunden, dass ihr Ehemann entführt und möglicherweise ermordet wurde. Sie hat keine Ahnung wer es getan hat, aber sie weiß wen sie fragen muss.
Langweiliges Hintergrundwissen:
Man sollte dieses Spiel wirklich nicht spielen. Wirklich nicht!